محیط فیزیکی خاک از لحاظ جوانه‌زنی بذر
رفتار مکانیکی، سله بستن و تراکم خاک
رفتار مکانیکی خاک از طریق پیوندهای درون و بین ذرات (به ترتیب پیوستگی و چسبندگی) تعیين می‌شود. این پیوندها همانطوری که فواصل بین ذرات و واحدهای خاک کاهش می‌یابد قوی‌تر می‌شوند (به عنوان مثال به طوری که وزن مخصوص ظاهری افزایش می‌یابد). این نیروها در مقاومت خاک به برش توسط وسایل خاکورزی، قابلیت فشردگی تحت فشار وسایل نقلیه، مقاومت به نفرذ توسط ستون هرمی و مقاومت کششی مشخص می‌شوند. مقاومت ظاهری خاک بر جذب آب توسط بذر تاثیر دارد (شکل 1).
شکل 1ـ مقاومت ظاهری خاک بر جذب آب توسط بذر تاثیر دارد.
بنابرابن، به نوبه خود می‌تواند به جوانه‌زنی بذر و استقرار آن آسیب برساند. مقاومت مکانیکی خاک می‌تواند از طریق تاثیر بر طویل شدن ریشه‌‌چه و ریشه‌ها، ظهرر کولئوپتیل و هیپوکوتیل و از طریق سله بستن خاک نیز استقرار گیاهچه را کاهش دهد. از هم پاشیدن ساختمان خاک و ورقه ورقه شدن خاک، به واسطه مرطوب شدن سریع سطح خاک باعث می‌شود (به علت پایداری پایین ساختمان خاک، برخورد قطرات باران، مرطوب شدن سریع) که این امر به تراکم و انسدادهای منافذ خاک منجر گردد و باعث کاهش نفوذ آب و تهویه شود. این سله‌ها عمدتا مانع از ظهور جوانه‌ها می‌شوند (شکل 2).
شکل 2ـ عمدتا تشکیل سله در خاک مانع از ظهور جوانه‌ها می‌شود.
با متراکم و خشک‌تر شدن خاک مقاومت ظاهری افزایش می‌یابد. تراکم خاک باعث فشرده شدن خاک به واسطه انقباض یا فشارهای خارجی می‌شود. بنابراین تراکم، تخلخل کل خاک، اندازه منافذ، تبادل گازی، و نفوذ آب را کاهش می‌دهد و مقاومت ظاهری خاک به نفوذ، آسیب به توزیع فضایی آب و محدود کردن جوانه‌زنی بذر و استقرار جوانه را نیز افزایش می‌دهد. تخفیف کامل یک آسیب ناشی از محیط فیزیکی خاک به فرایند آسیب بستگی دارد. اثر زیان‌آور سله‌ها را می‌توان به سادگی با شکستن سله‌هایی که به تازگی تشکیل شده‌اند کاهش داد، اما اصلاح و احیای کامل خصوصیات خاک متراکم تقریبا غیر ممکن است. انرژی زیادی برای تبدیل کردن خاک متراکم به بستر بذر مناسب مورد نیاز می‌باشد. چنین تلاش‌هایی معمولا منجر به ایجاد بستر بذر درشت تر، استقرار نامناسب و عملکرد پایین‌تر می‌گردد.
رژیم‌های رطوبتی خاک
در خاک خشک، مقدار کمی آب روی ذرات جذب شده است (آب هیگروسکوپیک)، در حالی‌که در یک خاك اشباع منافذ به طور کامل با آب پر می‌شود. بخش رطوبت حجمی در خاک به ویژه در لایه بالایی خاک به طور گسترده‌ای تغییر می‌کند. این تغییر به شرایط اقلیمی و محیطی بستگی دارد (مانند باران، تبخیر، زهکشی، پوشش گیاهی).